(آشنایی با لمپس) شبیه سازی و محاسبه مدول یانگ (Youngs Modulus) برای آلومینیوم بالک (Bulk)‌ با نرم افزار LAMMPS

(آموزش LAMMPS) در این شبیه سازی دینامیک مولکولی شما خواهید دید که چگونه مدول یانگ (Young's Modulus) جسم حجیم آلومینیوم (Bulk) محاسبه می شود. این روش می تواند برای عناصر دیگر هم کاربرد داشته باشد. آنسامبل مورد استفاده NVT می باشد. دمای سیستم با استفاده از ترموستات نوز-هوفر روی ۳۰۰ کلوین نگه داشته شده است. مدت آموزش ۴۲ دقیقه می باشد. تاریخ انتشار ۹۵/۴/۱۰ ...

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی بدست آوردن ثابت شبکه و انرژی بستگی (Cohesive Energy) برای آلومینیوم به کمک لمپس LAMMPS

(آموزش LAMMPS) در این آموزش تصویری عنصر آلومینیوم در یک شبکه با ثابت شبکه دلخواه شبیه سازی می شود. سپس با استفاده از دستورات minimize  و fix   box/relax انرژی سیستم را به کمینه حالت می رسانیم سپس ثابت شبکه Lattice Constant و انرژی بستگی Cohesive Energy را بدست می آوریم. مدت آموزش در حدود ۳۵ دقیقه است. تاریخ انتشار ۹۵/۳/۳۱ ...

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی تاثیر کرنش (Strain) بر ضریب هدایت گرمایی (Thermal Conductivity) نانولوله کربنی با LAMMPS

(آموزش LAMMPS) در این آموزش تصویری یک نانولوله کربنی (SWCN) تحت کرنش (Strain) قرار می گیرد و سپس ضریب هدایت گرمایی Thermal Conductivity را برای نانولوله کربنی محاسبه می کنیم. نتیجه این شبیه سازی با حالت بدون کرنش مقایسه می شود. این عمل در فرآیند تنظیم کردن Tuning ضریب هدایت گرمایی کاربرد دارد. با این روش می توانید کرنش را به دلخواه تغییر داده و  مقدار ضریب هدایت گرمایی را به مقدار دلخواه برسانید. این آموزش در لینوکس ابونتو تهیه شده و برای کابران سیستم عامل ویندوز نیز قابل استفاده است. تاریخ انتشار ۹۵/۳/۲۸ ...

(آشنایی با لمپس) نحوه اجرای تعداد زیادی برنامه لمپس (LAMMPS) بصورت متوالی با یک دستور

(آموزش lammps) بعضی مواقع نیاز است برنامه های لمپس LAMMPS بصورت متوالی اجرا شوند. مثلا می خواهید برنامه ی شما اگر نصف شب تمام شد بدون اینکه نیاز باشد شما از خواب بیدار شوید و برنامه بعدی را اجرا قرار دهید بصورت خودکار برنامه بعدی اجرا شود. در این صورت زمان شما برای اجرای برنامه تلف نخواهد شد. یا یک مثال دیگه! فرض کنید ۵۰ تا برنامه دارید که در عرض یک هفته قرار هست اجرا شوند و شما میخواهید در عرض این یک هفته از خوابگاه به خانه بروید. نیاز است که برنامه ها بصورت خودکار پشت سر هم اجرا شوند. در این صورت چکار باید کرد؟ این آموزش به شما کمک می کند که این کار را انجام دهید.مدت زمان آموزش ۳۰ دقیقه و حجم فایل 80 مگابایت هست. این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۹۵/۲/۲۶ ...

(آشنایی با لمپس) نحوه اجرای تعداد زیادی برنامه لمپس (LAMMPS) بصورت متوالی با یک دستور

(آموزش lammps) بعضی مواقع نیاز است برنامه های لمپس LAMMPS بصورت متوالی اجرا شوند. مثلا می خواهید برنامه ی شما اگر نصف شب تمام شد بدون اینکه نیاز باشد شما از خواب بیدار شوید و برنامه بعدی را اجرا قرار دهید بصورت خودکار برنامه بعدی اجرا شود. در این صورت زمان شما برای اجرای برنامه تلف نخواهد شد. یا یک مثال دیگه! فرض کنید ۵۰ تا برنامه دارید که در عرض یک هفته قرار هست اجرا شوند و شما میخواهید در عرض این یک هفته از خوابگاه به خانه بروید. نیاز است که برنامه ها بصورت خودکار پشت سر هم اجرا شوند. در این صورت چکار باید کرد؟ این آموزش به شما کمک می کند که این کار را انجام دهید.مدت زمان آموزش ۳۰ دقیقه و حجم فایل 80 مگابایت هست. این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۹۵/۲/۲۶ ...

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی بدست آوردن ثابت شبکه و انرژی بستگی (Cohesive Energy) برای آلومینیوم به کمک لمپس LAMMPS

(آموزش LAMMPS) در این آموزش تصویری عنصر آلومینیوم در یک شبکه با ثابت شبکه دلخواه شبیه سازی می شود. سپس با استفاده از دستورات minimize  و fix   box/relax انرژی سیستم را به کمینه حالت می رسانیم سپس ثابت شبکه Lattice Constant و انرژی بستگی Cohesive Energy را بدست می آوریم. مدت آموزش در حدود ۳۵ دقیقه است. تاریخ انتشار ۹۵/۳/۳۱ ...

(آشنایی با لمپس) نحوه اجرای تعداد زیادی برنامه لمپس (LAMMPS) بصورت متوالی با یک دستور

(آموزش lammps) بعضی مواقع نیاز است برنامه های لمپس LAMMPS بصورت متوالی اجرا شوند. مثلا می خواهید برنامه ی شما اگر نصف شب تمام شد بدون اینکه نیاز باشد شما از خواب بیدار شوید و برنامه بعدی را اجرا قرار دهید بصورت خودکار برنامه بعدی اجرا شود. در این صورت زمان شما برای اجرای برنامه تلف نخواهد شد. یا یک مثال دیگه! فرض کنید ۵۰ تا برنامه دارید که در عرض یک هفته قرار هست اجرا شوند و شما میخواهید در عرض این یک هفته از خوابگاه به خانه بروید. نیاز است که برنامه ها بصورت خودکار پشت سر هم اجرا شوند. در این صورت چکار باید کرد؟ این آموزش به شما کمک می کند که این کار را انجام دهید.مدت زمان آموزش ۳۰ دقیقه و حجم فایل 80 مگابایت هست. این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۹۵/۲/۲۶ ...

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی گرافن آلایش شده (Doped graphene) با اتم نیتروژن و بور به کمک نرم افزار لمپس (LAMMPS)

(آموزش lammps) در این آموزش تصویری عمل آلایش کردن (Doping) گرافن را با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی شبیه سازی می کنیم. شما یاد خواهید گرفت که چگونه اتم نیتروژن و بور را بصورت درصدی و در نواحی دلخواه روی گرافن آلایش کنید. عمل آلایش کردن باعث می شود خصوصیات ترمودینامیکی و مکانیکی گرافن تغییر کند. در واقع با این عمل خصوصیات گرافن تنظیم می شود. در مدت زمان ۲۲ دقیقه این آموزس را یاد خواهید گرفت. حجم فایل ۸۰ مگابایت و به فرمت mp4 می باشد.این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۹۵/۲/۱۱ ...

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی بررسی انتشار ترک در گرافن (Graphene) به سه حالت با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS)

(آموزش lammps) در این آموزش یک گرافن (Graphene) با ابعاد ۱۰ نانومتر در ۱۰ نانومتر با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS) شبیه سازی شده است. برای مدل کردن برهمکنش بین اتمی از پتانسیل ترسوف (Tersoff) استفاده کرده ایم. در این شبیه سازی به سه حالت انتشار ترک را بررسی کرده ایم. در اینجا کمیتی مورد محاسبه قرار نگرفته است و فقط فایل های ورودی و دیتا ساخته شده و دستوراتی را اضافه کرده ایم تا ترک را در گرافن ببینیم. تمامی فایل های این سه حالت به همراه این آموزش تقدیم خواهد شد. کیفیت فیلم HD می باشد.مدت زمان آموزش ۳۰ دقیقه می باشد. تاریخ انتشار ۹۵/۱/۲۸ ...

(آشنایی با لمپس) - آشنایی مقدماتی با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به کمک شبیه سازی گاز آرگون

(آموزش lammps) در این آموزش آشنایی مقدماتی با شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS) پیدا می کنید. با استفاده از شبیه سازی گاز آرگون سعی کردیم نحوه استفاده از راهنمای خود لمپس را آموزش داده و همچنین بصورت دقیق به دستورات موجود در این شبیه سازی بپردازیم و آن ها را توضیح دهیم. این شبیه سازی برای کسانی که می خواهند با لمپس آشنا شوند توصیه می شود. فایل شبیه سازی در کنار آموزش تقدیم خواهد شد. حجم فایل در حدود ۸۸ مگابایت و طول آموزش ۳۶ دقیقه با کیفیت HD می باشد. تاریخ انتشار ۲۶ فروردین ۹۵ ...

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

(آموزش lammps) در این آموزش مولکول DNA را به روش دینامیک مولکولی در داخل آب و یون شبیه سازی کردیم. در مورد مولکول دی ان آ توضیحاتی داده ایم. نحوه تولید دیتا فایل و فایل ورودی گام به گام توضیح داده شده است. در آخر سر از برنامه اجرا گرفته و با استفاده از VMD آن را نمایش داده ایم. میدان نیرو چارم (Force Field CHARMM) در این شبیه سازی استفاده  شده است. مدل آب نیز TIP3P می باشد. طول فیلم ۵۰ دقیقه با کیفیت HD می باشد.این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است.  تاریخ انتشار ۱۶ فروردین ۱۳۹۵ ...

(آشنایی با لمپس) - آموزش پکمول (Packmol) برای ایجاد پیکربندی اولیه برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

برای ایجاد پیکربندی اولیه در شبیه سازی مولکولی نیاز به نرم افزار پکمول (Packmol) دارید. این نرم افزار مولکولهای شما را به تعداد دلخواه و با چگالی معین در جعبه شبیه سازی شما قرار می دهد. این آموزش در محیط لینوکس ubuntu بوده و مدت آن ۲۱ دقیقه و حجم آن ۷۲ مگابایت است. فرمت فایل mp4 می باشد. تاریخ انتشار: ۶ فروردین ۱۳۹۵ ...

آموزش نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی لمپس به زبان فارسی

LAMMPS یا همان شبیه‌سازی برای دستگاه‌های پر ذره که با موازی سازی می‌تواند شبیه‌سازی‌های پیچیده را اجرا کند. برای بررسی سیستم‌های مولکولی نمی‌توان از روش‌های بر پایه ٔ محیط پیوسته استفاده کرد، چون دینامیک سیستم بسیار سریع بوده و از طرفی محیط فرایند هم پیوسته نیست؛ لذا از روش شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده می‌شود، که برمبنای مکانیک کلاسیک بوده و لمپس یکی از نرم‌افزارهایی است که می‌توان با آن، براساس روش دینامیک مولکولی بسیاری از سیستم‌های اتمی مولکولی را شبیه‌سازی نمود .   توسعه ٔ لمپس از سال ۱۹۹۰ توسط CRADA شروع شد و بین آزمایشگاه DOE (سندیا و LLNL ) و سه شرکت کری و بریستول و داپنت بود، که هدف آن توسعه ٔ کد نویسی به صورت کلاسیکی و موازی برای حالت بزرگ مقیاس می‌باشد. استون پلیمپتون در سندیا تلاش‌های بسیاری برای کد نویسی آن انجام داد. ظهور نسخه ٔ F 77 منجر به تولید LAMMPS 99 شد و پس از ساخت F 90، LAMMPS 2001 تولید شد. بازنویسی لمپس از فرترن به C++ و تولید کد منبع باز آن در سال ۲۰ ...

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی و محاسبه مدول یانگ (Youngs Modulus) برای آلومینیوم بالک (Bulk)‌ با نرم افزار LAMMPS

(آموزش LAMMPS) در این شبیه سازی دینامیک مولکولی شما خواهید دید که چگونه مدول یانگ (Young's Modulus) جسم حجیم آلومینیوم (Bulk) محاسبه می شود. این روش می تواند برای عناصر دیگر هم کاربرد داشته باشد. آنسامبل مورد استفاده NVT می باشد. دمای سیستم با استفاده از ترموستات نوز-هوفر روی ۳۰۰ کلوین نگه داشته شده است. مدت آموزش ۴۲ دقیقه می باشد. تاریخ انتشار ۹۵/۴/۱۰ ...

معرفی و نصب نرم افزار تعمیم یافته LAMMPS به نام liggghts (مخصوص مواد دانه ای) و اجرای یک مثال و نمایش نتیجه

در این آموزش شما با نرم افزار liggghts آشنا می شوید. نحوه نصب این نرم افزار و اجرای یک مثال را مشاهده می کنید. همچنین نحوه نمایش نتیجه شبیه سازی را با paraview را یاد خواهید گرفت.نرم افزار liggghts مخفف LAMMPS improved for general granular and granular heat transfer simulations است. دستورات liggghts شبیه نرم افزار lammps می بشد. این نرم افزار برای شبیه سازی مواد دانه ای بهینه شده است. همچنین شما می توانید هدایت گرمایی در مواد دانه ای را در این نرم افزار محاسبه کنید. شبیه سازی SPH هم در این نرم افزار امکان پذیر هست. ...