مقاله ترجمه شده توالی ژنومی کل پاتوژن های باکتریایی: تجزیه و تحلیل شیوع بیماری های منتقله بیمارستانی

مقاله ترجمه شده توالی ژنومی کل پاتوژن های باکتریایی: تجزیه و تحلیل شیوع بیماری های منتقله بیمارستانی

توضیحات:

مقاله ترجمه شده توالی ژنومی کل پاتوژن های باکتریایی: تجزیه و تحلیل شیوع بیماری های منتقله بیمارستانی، در قالب فایل word، به همراه فایل pdf مقاله انگلیسی سال 2017.

بخشی از متن ترجمه:

شیوع باکتری های مقاوم به داروی ترکیبی از چند دارو نشانگر یک تهدید جدی برای جمعیت های آسیب پذیر بیمار در بیمارستان های سراسر جهان است. بیماران بخش مراقبت های ویژه (ICU) به دلیل داشتن وسایل اتصالی مانند سوند داخل عروقی، سایر ابزارهای خروجی و لوله های داخل دهانی برای تنفس به ویژه در معرض عفونت های بیمارستانی هستند. افزایش آسیب پذیری بیماران آلوده به عفونت در ICU نشان دهنده اهمیت رعایت پروتکل های موثر مدیریت شیوع بیماری در بیمارستان است. درک انتقال عوامل بیماری زا از طریق روش های ژنوتیپ رویکرد بسیار مهمی برای مدیریت و جلوگیری از شیوع عوامل بیماری زا است. اخیراً، توالی کل ژنوم (WGS) پاتوژن ها به عنوان ابزاری برای ژنوتیپ در دسترس و مقرون به صرفه تر شده است. اخیرا تجزیه و تحلیل کل ژنوم پاتوژن از طریق WGS می تواند با استفاده از WGS تاثیر بی سابقه ای در از بین بردن اسیب های احتمالی مرتبط با باکتری ها داشته و رویکرد تجزیه و تحلیل شیوع بیماری را در بیمارستان ها متحول کند.

فهرست مطالب :
خلاصه
مقدمه
تعریف شیوع
روش های مولکول مرسوم
فن اوری طبقه بندی غیر تشدیدی
محدودیت روش های چند قطبی محدود
یونیزاسیون دفع لیزر به کمک ماتریس - طیف سنجی جرمی وزن
الکتروفورز ژل پالسی
فن آوری های تایپ مبتنی بر تشدید
تجزیه و تحلیل متوالی متغیر عددی در چند مکان
تکثیر توالی چند مرحله ای
تکثیر ژن ویروس
نیاز به WGS برای تجزیه و تحلیل شیوع
مواد و روش ها
توالی فن آوری
Illumina
اصل فناوری
مشخصات
فناوریهای نانوپلی آکسفورد
اصل فناوری
مشخصات
طول زمان ، عمق و میزان خطا را از دیدگاه بخوانید
ابزارهای آنالیز شیوع WGS
ابزارهای مبتنی بر وب
ابزارهای خط فرمان
مجموعه کامل نرم افزارهای تجزیه و تحلیل
مونتاژ
مروری بر فناوری مختصر
(i)مونتاژکننده های مبتنی بر نمودار Bruijn
مروری بر فناوری خاص
اجماع طرح دارای همپوشانی
مونتاژ هیبریدی
خصوصیات ژنوم
شناسه
(i) ابزارهای مبتنی بر وب
(ii) ابزارهای خط فرمان
واگیری
ابزارهای مبتنی بر وب
مقاومت ضد میکروبی
(i) ابزارهای مبتنی بر وب
ژنتیک تطبیقی
تجزیه و تحلیل SNP بدون مرجع
تجزیه و تحلیل SNP مبتنی بر مرجع
تجزیه و تحلیل مبتنی بر پانگنوم
ژنوم هسته LST
MLST کل ژنوم
ابزارهای مبتنی بر وب
PubMLST
فیلوژنی
NDtree
ابزار خط فرمان
kSNP3
Roary
Pan-Seq
Lyve-SET
فیلوژنی
ابزار خط فرمان
RAxML
مجموعه کامل نرم افزارهای تجزیه و تحلیل شیوع
نرم افزار تجاری
BioNumerics
(ب) ریدوم
تشخیص پاتوژن NCBI (بتا